สองปีหลังจากเหตุการณ์ในอียิปต์ เหล่าออโต้บอทส์และพันธมิตรที่เป็นมนุษย์ได้ค้นพบชิ้นส่วนของเทคโนโลยีไซเบอร์โทรเนียนที่สูญหายไป ซึ่งอยู่ในความครอบครองของมนุษย์เป็นเวลาหลายปี มีการเปิดเผยว่าสิ่งประดิษฐ์ดังกล่าวเป็นส่วนหนึ่งของยานอวกาศออโตบอตที่ชนดวงจันทร์ระหว่างภารกิจอพอลโล 11 สู่ดวงจันทร์ และมีเทคโนโลยีพิเศษและเซนติเนล ไพรม์ ในตำนาน อย่างไรก็ตาม แซม ค้นพบแผนการสมรู้ร่วมคิดของ ดิเซปติคอนส์ ที่วางแผนจะใช้มันเพื่อจุดประสงค์ชั่วร้ายของพวกเขาเอง และออปติมัส ไพรม์พบว่าพวกเขากำลังต่อสู้กับภัยคุกคามที่วางแผนที่จะใช้มันเพื่อทำให้มนุษยชาติเป็นทาสเพื่อฟื้นฟูไซเบอร์ตรอน