เป็นเรื่องราว หลังจากผ่านมา 12 ของการจับตัว โซโลมอน เลน หัวหน้ากลุ่มก่อการร้ายซินดิเคต กลุ่มซินดิเคตได้กลายสภาพเป็นกลุ่มใหม่ชื่อ “ดิอะพอสเทิลส์” (The Apostles) ที่เบลฟาสต์ อีธาน ฮันต์ สายลับ IMF ได้รับภารกิจให้ขัดขวางการขายแกนพลูโตเนียมสามลูกให้กลุ่มดิอะพอสเทิลส์ โดยมีผู้ว่าจ้างคือจอห์น ลาร์ก แต่ภารกิจล้มเหลวเมื่อฮันต์เลือกจะรักษาชีวิตลูเธอร์ สติกเคลล์ ลูกทีมของเขาและแกนพลูโตเนียมถูกขโมยไปได้ ทีมของอีธานจึงจับตัวนักวิทยาศาสตร์ผู้ได้รับการว่าจ้างจากลาร์กให้สร้างระเบิดจากแกนพลูโตเนียมเพื่อเค้นข้อมูล